A fada Bloom passa por momentos difíceis ao tentar adaptar-se à sua nova vida como princesa e ao mesmo tempo resolver os assuntos que envolvem o seu casamento com Sky, o legítimo soberano do Reino de Domino. Enquanto isso, no Reino da Dimensão Mágica, os seus amigos estão envolvidos com grandes perigos: Icy, Darcy e Stormy, as descendentes directas das cruéis Bruxas Ancestrais que, depois de terem roubado um objecto misterioso na Escola das Fadas de Alfea, pretendem destruir a famosa Árvore da Vida que mantém o equilíbrio entre as magias branca e a negra. Determinada a juntar-se aos amigos, Bloom regressa para os ajudar a travar a luta final em prol do equilíbrio de forças entre o Bem e o mal.