O mundo perfeito é algo desejado por todos, e no ano de 2013, a cidade chamada de No. 6 parece ter finalmente este desejo. Em meio a essa cidade conhecemos o jovem rapaz chamado Shin, uma criança rodeada da mais fina criação desde os seus 2 anos de idade. Porém, seu mundo parece desabar quando ele ajuda outro garoto chamado Nezumi, que fugia de uma clínica de reabilitação misteriosa do governo. Shin acaba sendo expulso por colaborar com o estranho jovem e conhece outros lugares de No. 6 com uma realidade bem diferente da que ele conhece. Quatro anos depois, os jovens se unem e começam a investigar diversas conspirações que cercam a cidade perfeita, mas tudo com um grande problema: Shin é acusado de um assassinato, e agora terá que provar a sua própria inocência em meio à corrupção.